分子蒸餾器主要用于其溫度敏感且不穩定的化合物進行分離提純，設備中的控制體系主要用來減小其物料的沸點，其結構可以良好控制物料，主要以薄膜形式通過設備的表明進行加熱。
       在運行的過程中其設備的冷凝面以及薄面直接就會直接形成其壓力差，這個所形成的壓力差是整個蒸汽流向的驅動力，設備中微小的壓力降就會直接引起蒸汽出現流動的情況，分子蒸餾運行時冷凝面以及沸騰面之間的距離是比較短的。
       在使用的過程中其物料在分子蒸餾器里面所停留的時間是很短的，這樣的設備裝置也適合其高粘度的物料，在進行選擇的過程中可以采用良好的制作材料，都是采用熱膨脹系數小且化學較穩定的石英玻璃材料。
       分子蒸餾器運行的過程中其強度是很高的，這樣的設備在進行使用的過程中具有良好的耐腐蝕的性能，這樣的產品對于大多數的試劑以及化學材料都有良好的適用性能。